ミノキシジルの副作用には、頭痛、意識朦朧、多毛症、性的不能、低血圧、不静脈、動悸、皮膚の紅潮、霞み目、手・足・顔のしびれや痛み、性欲減退、胸の痛み、体重増加、下肢・手・足・顔のむくみなどがあげられます。
またその他副作用として初期脱毛が引き起こされます。